期刊简介
本刊系肿瘤专业的学术刊物，主要报道肿瘤基础研究、实践研究、临床及流行病学研究成果。
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- 杂志名称：肿瘤杂志
- 主管单位：中华人民共和国教育部
- 主办单位：上海市肿瘤研究所 上海交通大学医学院附属仁济医院
- 国际刊号：1000-7431
- 国内刊号：31-1372/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：中文核心期刊期刊收录：国家图书馆馆藏, 上海图书馆馆藏, 农业与生物科学研究中心文摘, 万方收录(中), 哥白尼索引(波兰), 文摘与引文数据库, CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), CA 化学文摘(美), JST 日本科学技术振兴机构数据库(日), 医学文摘, 剑桥科学文摘, 知网收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中)
非编码长链RNA LOC100130476在食管鳞癌中的表达及其甲基化状态
师雅斌；郭炜；崔建利；郭艳丽；沈素朋；郭鑫；董稚明
关键词：食管肿瘤, 长链非编码RNA, DNA甲基化
摘要：目的:检测人食管癌细胞系及食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)组织中长链非编码RNA (long non-coding RNA,lncRNA) LOC100130476的表达情况及其甲基化状态,并探讨lncRNALOC100130476在食管鳞癌发生及发展中的作用.方法:分别应用RT-PCR以及甲基化特异性PCR(methylation specific PCR,MSP)法检测DNA甲基化转移酶抑制剂5-氮杂-2'-脱氧胞苷(5-aza-2'-deoxycytidine,5-Aza-dC)处理前后的食管癌细胞系TE1、TE13、T.TN和Ec109细胞中以及食管鳞癌组织及其相应癌旁正常组织中lncRNA LOC100130476的表达情况和甲基化状态.结果:未经5-Aza-dC处理的食管癌TE1、TE13和T.TN细胞中lncRNALOC100130476的表达均为阴性,仅在Ec109细胞中为弱阳性表达;用5-Aza-dC处理后,TE1、TE13和T.TN细胞中lncRNA LOC100130476均转变为阳性表达,而Ec109细胞中lncRNA LOC100130476的表达水平也有所上调.TE1、TE13、TTN和Ec109细胞中,在5-Aza-dC未处理前lncRNA LOC100130476均表现为高甲基化的状态,应用5-Aza-dC处理后,Ec109细胞中lncRNA LOC100130476甲基化程度明显降低,TE1、TE13和T.TN细胞中的lncRNALOC100130476则均表现为非甲基化状态.LncRNA LOC100130476在食管鳞癌组织中的表达水平为0.49±0.09,明显低于癌旁正常组织的0.56±0.08 (P＜0.05),并与组织分化程度和TNM分期密切相关(P值均＜ 0.05).食管鳞癌组织中lncRNA LOC100130476第一外显子区的甲基化率为69.44％ (50/72),明显高于癌旁正常组织的26.39％ (19/72) (P＜0.05),并与组织分化程度和TNM分期密切相关(P值均＜ 0.05).发生lncRNA LOC100130476甲基化的食管鳞癌组织中lncRNA LOC100130476的表达量为0.47±0.08,明显低于未发生甲基化的食管鳞癌组织的0.55±0.08 (P＜0.05).结论:LncRNA LOC100130476在食管鳞癌中的异常低表达与食管鳞癌的发生和发展密切相关,其第一外显子区的甲基化可能是导致其表达沉默的机制之一.
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