期刊简介
本刊系肿瘤专业的学术刊物，主要报道肿瘤基础研究、实践研究、临床及流行病学研究成果。
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首页>肿瘤杂志
- 杂志名称：肿瘤杂志
- 主管单位：中华人民共和国教育部
- 主办单位：上海市肿瘤研究所 上海交通大学医学院附属仁济医院
- 国际刊号：1000-7431
- 国内刊号：31-1372/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：中文核心期刊期刊收录：国家图书馆馆藏, 上海图书馆馆藏, 农业与生物科学研究中心文摘, 万方收录(中), 哥白尼索引(波兰), 文摘与引文数据库, CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), CA 化学文摘(美), JST 日本科学技术振兴机构数据库(日), 医学文摘, 剑桥科学文摘, 知网收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中)
应用生物信息学方法识别卵巢癌重要基因
李辉
关键词：卵巢肿瘤, RNA-seq, 生物标志物
摘要：目的:上皮细胞卵巢癌是目前常见的妇科恶性肿瘤之一,其发病率每年都在升高.本次研究识别的重要基因能够预测上皮细胞卵巢癌患者的预后,阐释上皮细胞卵巢癌的发病机制.方法:本研究利用4对上皮细胞卵巢癌及其癌旁正常组织的转录组测序(RNA-Seq)数据进行差异基因的筛选,并应用Gene Ontology (GO)进行富集分析,在TCGA(The Cancer Genome Atlas)在线数据库中进行预后评估.结果:识别865个差异表达基因,通过功能注释识别13个有意义的GO类型,包括转录调控(regulation of transcription)、细胞黏附(cell adhesion)和生物黏附(biological adhesion).结合卵巢癌TCGA在线数据库,发现2个重要基因(FBXO5和CTNNB1)在高表达时,不利于上皮细胞卵巢癌患者的生存;并且在独立的另外20对上皮细胞卵巢癌及其癌旁正常组织的样本中,采用PCR证实了这2个基因的差异表达情况.结论:本研究识别出的重要基因有助于更好地了解上皮细胞卵巢癌的发生和发展机制,可能成为预后判断的生物标志物.
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